无尘车间维持一定的空气流量来保持清洁度和颗粒数。净化工程流量根据每小时的换气次数来确定，同时这也决定了风机尺寸、建筑构型和能量消耗。在保持洁净度的前提条件下，空气流速的降低可以降低建造及能耗成本。换气次数降低20%就可以使风机的尺寸降低50%。净化工程空气洁净度比节约能耗更重要，但是新的研究成果已经有降低洁净成本的记载了。
由于更衣的后段(穿洁净衣+气锁)的洁净级别与生产区相一致，医院气体呼叫系统工程净化，所以这两个区域必须监控其压差， 故压差计将设置在这两个房间与其他区域之间。净化工程另外根据洁净与非洁净区压差必须大于10Pa 的要求，该区域与其更衣前段区域的压差值应该大于10Pa。洁净度要求高的100级无尘车间按 GMP 第 32条的规定， “必要时，可将进入和离开洁净区的更衣间分开设置” 。退出通道的气流方向、洁净分区、压差控制等见典型更衣布置图。净化工程对洁净度要求搞的10无尘车间生产，如高致敏性、高活性、高毒性、或 LD50很小的制药品，净化工程投标，如需要限制药品暴露生产区的空气外泄，在更衣区域要设置退出通道并且通过负压阱，以阻隔生产区气流。
国内外测试资料表明，不同地区、不同环境的大气含尘、含菌浓度差异较大，为了有效控制洁净厂房中新风的含尘量与含菌量，食品净化工程，在新建或改建药厂是，厂址宜选在大气含尘、含菌浓度较低，净化工程，自然环境和水质良好，周围无污染源的地方，这是建设净化车间厂房的前提，在此原则上，厂区应避开室内工业集中的地区，远离铁路、码头、机场、交通要道以及散发大量粉尘、烟气和有害气体的地方。
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